Si le pilotage du Grand plan d’investissement est assuré par différents ministères, une coordination sera assurée par Guillaume Boudy à la tête du secrétariat général pour l'investissement (SGPI), placé auprès du Premier ministre, afin de garantir une cohérence globale. Par ailleurs, un comité de pilotage (Copil) est institué en tant qu’organe de gouvernance pour chacune des 25 initiatives (ou groupe cohérent d’initiatives) déclinant les axes du GPI. Chacun de ces Copil a pour mission d’établir les lignes d’action de l’initiative, de sélectionner des actions ou programmes d’action, d’exécuter des dépenses en cours d’année et d’assurer le suivi de l’initiative.
La composition de chaque Copil, précise la circulaire, devra être proposée au Premier ministre avant la fin du mois de janvier 2018. Les lignes d'action de chaque initiative, assorties d'indicateurs de suivi et de résultats, devront quant à elles être soumises à ce dernier au plus tard au premier trimestre 2018.
- la transition écologique : 20 milliards d’euros,
- la formation professionnelle : 15 milliards d’euros,
- la compétitivité et l’innovation : 13 milliards d’euros,
- la transformation numérique : 9 milliards d’euros.